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Tests disponibles :
Culture bactérienne
- Isolement d'organismes vivants.
- Types d'échantillons : exsudat fibrineux ou parenchyme du poumon ou de l'organe affecté.
- Avantages :
- Disponible dans la plupart des laboratoires.
- Le taux de réussite des isolements peut être considérablement augmenté en utilisant des écouvillons avec le milieu de transport Amies et en réfrigérant les échantillons.
- Coût relativement faible.
- La culture de souches spécifiques de l'élevage est utile pour :
- Sérotypage.
- Déterminer la sensibilité aux antimicrobiens.
- Isolement pour la production de vaccins.
- Inconvénients :
- Bactéries difficiles à cultiver en raison de leur nature exigeante et de leur survie limitée à température ambiante.
- Toutes les souches de G. parasuis ne sont pas pathogènes.
- Si les porcs ont été prétraités avec des antibiotiques, cela peut empêcher la croissance bactérienne.
Figure 1 : Photo de péricardite fibrineuse identifiée lors de l'autopsie. Le liquide et la fibrine sont de bons échantillons à prélever pour le diagnostic de G. parasuis.
Sensibilité aux antimicrobiens (antibiogramme)
- Test in vitro : capacité d'un organisme vivant à se développer sous des concentrations spécifiques de différents antimicrobiens.
- Types d'échantillons : exsudat fibrineux ou parenchyme du poumon ou de l'organe affecté.
- Avantages :
- Identification de la sensibilité ou de la résistance de souches spécifiques aux antimicrobiens courants.
- Identification des tendances de la résistance aux antimicrobiens.
- Inconvénients
- Il faut un isolat bactérien.
- Les tests in vitro peuvent différer légèrement des résultats in vivo.
- Certains antimicrobiens spécifiques peuvent ne pas être inclus ou nécessiter des tests spéciaux séparés.
- Coût modéré.
Figure 2 : Photo d'un exsudat fibrineux/fibreux à la surface du poumon. La fibrine et le parenchyme pulmonaire sont des échantillons à prélever pour le diagnostic de G. parasuis.
Polymerase chain reaction (PCR)
- Détecte la présence de séquences spécifiques d'acide nucléique (ADN) bactérien.
- Types d'échantillons : exsudat fibrineux ou parenchyme du poumon ou de l'organe affecté.
- Avantages :
- Sensibilité très élevée (peut détecter de petites quantités de bactéries).
- Peut détecter les bactéries mortes, ce qui contourne la difficulté de la culture en raison de sa nature exigeante et de sa survie limitée à température ambiante.
- Détection précoce : les cas aigus devraient être positifs.
- Coût modéré.
- Inconvénients :
- Ne prouve pas toujours la pathogénicité ou la virulence de l'isolat.
- Organisme faisant généralement partie d'infections secondaires ou de co-infections.
- Nécessite des amorces appropriées.
Sérotypage - PCR
- Technique PCR qui détecte la présence de séquences spécifiques d'acide nucléique (ADN) associées à des gènes de virulence.
- Avantages :
- Ne nécessite pas le stockage d'antisérums comme c'est le cas avec le sérotypage sérologique.
- Facilite la sélection appropriée du vaccin ou la production d'autovaccin (selon le sérotype).
- Inconvénients :
- Il faut un isolat bactérien.
- De nombreux isolats ne peuvent pas être typés.
- Prix modéré, mais généralement un seul isolat est testé.
Interprétation des résultats :
Culture bactérienne :
- Quantité :
- Élevée : hautement suggestive d'une contribution à la maladie.
- Modérée : hautement suggestive d'une contribution à la maladie.
- Faible : interprétation variable.
- Pas de croissance : animal peut-être déjà traité aux antibiotiques, infection chronique, manipulation incorrecte de l'échantillon ou la bactérie ne contribue pas à la maladie.
Sensibilité aux antimicrobiens (antibiogramme) :
- Sensible : bon choix possible pour le traitement si l'antimicrobien peut atteindre le tissu cible.
- Résistant : un autre antimicrobien doit être choisi.
- CMI : si une CMI (concentration minimale inhibitrice) est effectuée, il faut s'assurer que l'antimicrobien sélectionné atteint la valeur de CMI indiquée dans l'organe cible.
PCR :
- Positif : la bactérie est présente et la signification dépend de l'adéquation du type d'échantillon sélectionné.
- Négatif : négatif ou infection trop ancienne pour détecter la bactérie.
Sérotypage - PCR
- Identification adéquate du sérotype ou identifié comme non typable (commun).
Scénario
Porcs sevrés atteints de polyserosite :
- Pour chaque porc affecté, prélever des écouvillons individuels d'exsudat fibrineux, les placer dans un milieu de transport Amies et envoyer des échantillons réfrigérés au laboratoire pour une culture bactérienne, un antibiogramme et une PCR. Effectuer des tests individuels sur chaque spécimen ; ne pas les grouper en pools.
