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L'un des principaux objectifs après l'apparition d'un foyer de SDRP dans un élevage de truies est le retour à la stabilité avec l'absence de détection du virus SDRP à tous les stades de l'élevage.
La première étape pour atteindre l'objectif susmentionné est la stabilité à la naissance, car l'absence du virus SDRP chez les porcelets nouveau-nés permet de supposer que le virus ne circule probablement plus chez les truies gestantes. De cette manière, l'efficacité de toutes les actions mises en œuvre pendant et après l'épidémie de reproduction pour réduire la transmission et l'excrétion du virus chez les truies gestantes peut être évaluée sur la base de l'évolution de la détection du virus chez les porcelets à la naissance.
Au cours des dernières années, de nouveaux prélèvements ont été développés sur la base du concept de prélèvements regroupés, comme c'est le cas des fluides de traitement des porcelets décrits par Vilalta el al. (2019) et Trevisan et al. (2019). Par la suite, l'utilisation de langues de mort-nés ou de carcasses dans d'autres phases a été positionnée comme un système de surveillance avec de bons résultats selon les articles de Baliellas et Machado et al. (2022).
La surveillance à la naissance par les langues consiste à collecter les langues des mort-nés en tant qu'échantillon regroupé par bande de mise-bas ou pour une période de temps donnée. Nous recommandons un maximum de 50 langues par échantillon global et de les conserver congelées jusqu'à leur envoi au laboratoire, afin d'obtenir suffisamment de liquide à la base du sac pendant le processus de décongélation pour réaliser la technique PCR, évitant ainsi d'ajouter un milieu liquide à l'échantillon qui pourrait altérer le résultat en raison d'un effet de dilution de l'échantillon d'origine.
L'un des avantages de la collecte de langues de mort-nés en tant que système de surveillance de la stabilité à la naissance est que les charges virales des PCR positives au cours des premières semaines suivant l'épidémie sont beaucoup plus élevées (la plupart du temps, le Ct se situe entre 20 et 25) que, par exemple, les fluides issus de la transformation. Nous pouvons utiliser l'évolution du Ct dans les semaines qui suivent l'épidémie pour prédire que nous approchons de la stabilité à la naissance lorsque la valeur du Ct tend à augmenter vers la négativité (Ct=>40). Comme cette technique fournit une gamme de Ct plus large que les autres échantillons, elle améliore notre capacité à évaluer la tendance à atteindre la stabilité de l'élevage. Afin d'utiliser efficacement les ressources, la recommandation standard est de ne pas prélever d'échantillons de langues au cours des dix premières semaines suivant l'apparition de l'épidémie, car il est fort probable qu'ils soient encore fortement positifs avec un Ct très faible.
Par exemple, dans ce premier graphique, nous pouvons voir qu'à partir de la semaine 20 après l'épidémie, la charge virale de chaque sac de langues mortes diminue parce que la valeur Ct des résultats positifs de la PCR augmente ainsi que la fréquence des résultats PCR négatifs jusqu'à ce que des résultats PCR négatifs consécutifs (valeurs Ct=>40) soient atteints (figure 1).
Figure 1 : Évolution des valeurs Ct de la PCR dans les semaines suivant l'apparition du SDRP.
Dans ce deuxième exemple (figure 2), après 30 semaines de l'épidémie, il n'y a pas encore eu une seule semaine avec un résultat PCR négatif (valeurs Ct=>40) et la valeur Ct reste faible et constante, ce qui indique une possible recirculation continue au cours de la phase de gestation. Nous pouvons conclure que les mesures de contrôle n'ont pas été suffisantes et que des mesures supplémentaires doivent être prises. Figure 2 : Évolution des valeurs Ct de la PCR dans les semaines suivant l'apparition du SDRP.
Dans cette situation, nous recommandons de collecter séparément les langues des mort-nés des premières mises bas et du reste des cycles afin d'évaluer si la cause de l'instabilité continue est l'infection des truies gestantes au cours du premier cycle, pour laquelle nous détecterions plus d'échantillons positifs et une charge virale plus élevée dans les langues des premières mises bas.
Figure 3. Évolution des valeurs de Ct de la PCR dans les semaines suivant l'apparition du SDRP sur des échantillons de langues de mort-nés provenant de femelles primipares et multipares.
Enfin, dans le troisième élevage (figure 4), l'évolution est divisée en deux étapes. Entre les semaines 26 et 38, il semble que l'élevage se rapproche de la stabilité en raison de la fréquence accrue des résultats négatifs de la PCR et des faibles charges virales dans les résultats positifs. Vers la semaine 40, on observe une forte augmentation de la charge virale dans tous les échantillons suivants. Le séquençage de ces échantillons positifs a permis de déterminer l'introduction d'une nouvelle souche dans l'élevage et la cause probable de l'augmentation de la charge virale dans les résultats des échantillons hebdomadaires suivants.
Figure 4 : Évolution des valeurs Ct de la PCR dans les semaines suivant l'apparition du SDRP.
Nous pouvons conclure que la surveillance avec les langues de mort-nés est une technique non invasive, facile, peu coûteuse et qui, réalisée en routine, nous permet de prédire, après plusieurs semaines d'échantillonnage, si nous approchons de la stabilité à la naissance.
