L'influenza porcine peut persister endémiquement dans des élevages naisseurs-engraisseur
Les épisodes infectieux peuvent durer plus d'un mois au niveau de la population, ce qui explique qu'un nouveau lot comprenant beaucoup d'animaux susceptibles puisse être infecté si les animaux sont logés dans des cases différentes mais dans le même bâtiment (transmission aérienne).