Le service de recherche agricole du ministère américain de l'Agriculture (USDA-ARS) a annoncé que les chercheurs ont ramené la classification du nombre de souches du virus de la peste porcine africaine de 25 à seulement six génotypes uniques. Cette innovation scientifique pourrait contribuer à redéfinir la manière dont les chercheurs du monde entier classent les isolats du virus de la PPA et faciliter la mise au point de vaccins adaptés aux différentes souches circulant dans les zones d'endémie de PPA dans le monde.
"Auparavant, 25 génotypes différents du virus avaient été identifiés dans le monde entier", a déclaré Douglas Gladue, chercheur principal à l'ARS. "Notre équipe de recherche a récemment réévalué toutes les séquences d'ADN du virus accessibles au public et a constaté que la plupart des génotypes initialement identifiés comme nouveaux n'avaient pas été correctement identifiés et comparés aux génotypes existants du virus de la PPA. Selon cette analyse, il existe en fait moins de génotypes uniques que ne le pensait la communauté des chercheurs étudiant la PPA, ce qui signifie que la diversité de PPA touchant les communautés du monde entier est moindre. Cette information est importante car elle pourrait réduire le nombre de vaccins que l'on pensait nécessaires pour protéger contre tous les génotypes de PPA".
Dans le cadre de cet effort de grande envergure, des chercheurs de l'ARS ont réanalysé plus de 12 000 isolats de virus historiques et actuels. Cet effort a été rendu possible grâce à la puissance de calcul de SciNet, le groupe de superordinateurs de l'ARS destiné à résoudre les problèmes de big data agricole.
13 novembre 2023/ USDA/ Etats-Unis.